临床表现：多起病隐匿，病程常呈慢性，反复发作性。

　　腹痛：多为不典型的痉挛性疼痛，常发生于下腹及脐周。餐后加重，腹痛加剧提示炎症性病变在发展中，或内瘘、肠穿孔、肠梗阻、急性腹膜炎等并发症出现。
　　腹泻：每日大便2~6次，多无脓血及里急后重，如无结肠、直肠受累，无便血及肛周并发症。
　　呕吐：可继发于肠梗阻或肠痉挛，而引起反射性呕吐。
　　发热：为低热或中等热度，常间歇出现，急性重症患者或伴有化脓性病变时，可出现高热，寒战和毒血症表现。
　　腹部肿块：与病变部位有关，大小不一，以右下腹和脐周多见，比较固定。
　　全身症状：纳差、乏力、消瘦、焦虑、发育延缓、贫血及低蛋白血症。
　　肠外表现：关节炎、关节痛、口腔鹅口样溃疡、结节性红斑、虹膜睫状体炎、硬化性胆管炎和胆管周围炎，慢性活动性肝炎、脂肪肝、胆结石、血栓性静脉炎、强直性脊柱炎等。